Ulemper forbundet med historisk forskning omfatter bias utilgængelighed og ufuldstændighed. Fordi mange af de papirer eller referencer, der bruges, ikke oprindeligt var beregnet til at blive undersøgt, kan den information, der præsenteres, være overdrevet for at give mere interessante detaljer om en konto. Derudover er visse bøger eller artikler muligvis ikke blevet bevaret og kan derfor være utilgængelige eller ufuldstændige.
Historisk forskning kan omfatte selvbiografier af berømte personer eller dagbøger, der kaster forfatteren i et positivt lys. Derfor er oplysningerne ofte baseret på en øjenvidneberetning snarere end på faktuelle data. Derudover kan den udvundne forskning indeholde specifikke data, som en forsker måske ikke besidder eller har oplevet. Breve kan for eksempel antage en hel del forudgående information fra læserens side.
Roy Rosenzweig Center for Historie og Nye Medier profilerer digital historie på nettet og siger, at evnen til at gemme digitale medier giver bedre adgang til historiske begivenheder og information. Den ekstra kapacitet, der leveres af bits og bytes, gør det muligt for historikere at få adgang til videoer, artikler, billeder og en række dokumenter. Som et resultat heraf er lærde undervisere og den brede offentlighed i stand til at gennemgå alle slags data og derved give dem mulighed for at bruge medier, der er mere pålidelige.
